一九四八年，门诺会中央委员会，应前台湾神学院院长孙雅各布牧师之邀，差派数字医生、护士和志愿工作人员来台从事山地医疗和救济山胞的工作，并成立「基督教门诺会山地医疗团」在台湾全省山地展开医疗传道工作，及至薄柔烂医师来台，乃于一九五五年正式在花莲设立基督教门诺医院，进一步从事医疗传道工作。

由于医疗传道工作的进展，门诺会中央委员会乃请门诺会海外宣道会，考虑在台湾继续扩展宣教事工，经门诺会海外宣道会派员来台考察研究后，肯定在台开设新宣教区的需要，遂于一九五五年差派第一位宣教师宋戴维牧师来台从事宣道事工，当年，第一间门诺教会──台中林森路教会成立，以后，门诺教会陆续在台中，台北和花莲设立，至二○○○年，共有十八间。

信仰与教义

门诺会信徒相信「教会是由一群真正悔改，相信耶稣的信徒所组成。」所以他们的生活要「圣洁」，「分别为圣」简单朴素、心灵坦诚，他们以弟兄姐妹之情彼此相爱，在一切与人的关系上，持守和平、仁爱和不抵抗，主张废止战争、暴力并一切置人于死之事。

依据门诺会总会的教义宣言，信仰如下：
◎ 上帝是全能的父，创造天地万物之主。

◎ 坚信基督完全神性人性的教义，承认基督耶稣为主为救主，是我们信仰唯一的根基。

◎ 圣灵是我们的保惠师也是引导者。

◎ 圣经的原则和教训，是信仰及生活唯一有权威的准则。

◎ 得救是本乎恩，也因着信基督。而重生是信徒于基督里所得着新生命的体验。

◎ 洗礼当施行于承认耶稣基督为主为救主和信仰告白的人。

◎ 定期遵守圣餐，以纪念基督的受难及死。

◎ 遵照圣经的教训，纠正犯过的信徒，挽回他与教会有正常的交谊。

◎ 信从圣经关于诚实的教训，不可起誓。

◎ 基于爱的表现，就是基督及初期教会所教训，实行圣经所载的「无抵抗行为」。

◎ 忠诚管理受主所托的生活与产业。